Full Metal Panic! The Second Raid

Három hónap telt el az első sorozat lezárulása óta. Sousuke kénytelen két élete között ide-oda futni. A Mithril egy új ellenség miatt riadókészültségben áll, Sousukera pedig szükség van a Lambda meghajtó miatt, hiszen csak ő tudja használni. A Jindai iskolában ezen közben eredeti feladata szólítja, továbbra is meg kell védenie Chidori Kanamet. Az új ellenség célja, hogy polgárháborút robbantson ki Kínában. Az ellenségek közül a sorozat a pszichopata Gates-t és egy ikerpárt emel ki, akiket egy, a sorozat végéig ismeretlen ellenség bérel fel. Bonyodalmak ott kezdődnek, mikor Sousuke azt a parancsot kapja, hogy régi feladatát adja át, vagyis Chidori Kaname oltalmazását. Ennek következtében Sousuke veszít a harci szelleméből, ami persze a Lambda meghajtó használatát is megnehezíti, sőt... Chidori pedig nagy veszélybe kerül, mert egymaga kell szembenézzen az őt üldöző ikrekkel!